La actividad de Ciencia, Tecnología e Innovación de la UNICA se desarrolla teniendo en cuenta las indicaciones de las políticas de Ciencia e Innovación Tecnología, las prioridades Nacionales, Sectoriales y Territoriales que corresponden a los intereses del país; evidenciando una integración efectiva entre la actividad científica, la innovación tecnológica y la educación de postgrado.
Se concentran las líneas de investigación y se establecen prioridades en la universidad, a través de la ejecución de proyectos de investigación científica, tecnológica y de innovación, interdisciplinarios, transdisciplinarios y multidisciplinarios en las líneas de: